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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
（新春走基层）青海门源地震受灾民众：新房里迎新年******
中新网西宁1月18日电 题：青海门源地震受灾民众：新房里迎新年
作者 李隽 陈文年
18日是中国农历腊月二十七，距除夕只有两天。
在青海省海北藏族自治州门源回族自治县东川镇孔家庄村，范有军夫妻俩将小年那天烙好小灶饼端上餐桌，两个女儿和儿子陆续上桌，一家人吃起了早饭。
“两个女儿和儿子常年在外地打工，过年才能回家和家人团聚。”范有军说，孩子们在外打工时问得最多的就是他俩的身体和这个新家了。
图为厨房内设施齐全。 陈文年 摄“世界再美，都不及回家的路。”这是小女儿范文珠回家发的朋友圈。“今年回来，一幢崭新的钢筋混凝土砖房出现在眼前，心里别提多高兴了。”范文珠说。
2022年1月8日，青海省海北州门源县发生6.9级地震，震源深度10千米，最高烈度为Ⅸ度(9度)。
在这次地震中，范有军家的房屋受损成了危房，当地官方第一时间查看受灾情况，并将一家人搬出危房，没过几天就是2022年春节。
“虽然经历了地震，但家人都没事，政府的关怀也让我们过了个温暖的春节。”范有军回忆说，去年春节后孩子们又外出打工，那时候受灾房屋还没有拆除。
五间大瓦房，宽敞的玻璃，烧起暖气，地板砖锃亮，还有最方便的上下水……比起旧房子，范有军家的房子成了孔家庄村里最漂亮、最坚固、抗震等级最高的房子。
图为新家的卧室宽敞洁净。 陈文年 摄“因祸得福，住上这么好的房子是今年我们一家最幸福的事情。”范有军高兴地说。
据门源县灾后民房恢复重建相关数据显示，该县11个受灾乡镇共拆除建设D级危房710户，重建工作现已全部完成，大部分受灾民众已入住。(完)
图为新建房屋外观。 陈文年 摄（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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